厌氧菌（anaerobic bacteria）是指无氧或氧化还原电势低的条件下才能生长繁殖的一类细菌。这类细菌由于缺乏完善的酶系统，因此只能以无氧发酵进行能量代谢。

厌氧菌在自然界分布广泛，包括环境、土壤、水源和动物中。其中，人体本身也有众多的厌氧菌，大多存在于人体和动物的皮肤、腔道的深部黏膜表面。

1.对氧极端敏感的厌氧菌：这类细菌对厌氧条件要求很高，在空气中暴露10min即死亡，临床上很难分离出。2.中度厌氧菌：此类厌氧菌较为常见，在相应的技术条件下，容易被分离出，即使在空气中暴露60～90min或在脓汁抽出72h后仍然能被分离出来。3.耐氧厌氧菌：这类细菌不能利用氧，在无氧条件下生长好，而在有氧条件下生长不佳。

破伤风梭状芽胞杆菌（Clostridium etani）是引起破伤风的病原菌，为革兰氏阳性厌氧菌，长 4～8μm，宽 0.3～0.5μm。它以芽胞形式广泛分布于自然界中，如泥土、人畜肠道、粪便、皮肤和锈器表面等。在缺氧环境中，破伤风杆菌芽胞发育为增殖体，迅速繁殖并产生大量破伤风溶血毒素和破伤风痉挛毒素。

产气荚膜杆菌(Clostridium perfringen)，为梭状芽胞杆菌类属，是厌氧、无动力、能产生芽胞的革兰氏阳性粗大杆菌，单独或成双排列，两段钝圆，芽孢大，卵圆形，位于次端，在机体内可形成荚膜。产气荚膜梭菌属于人和动物肠道内正常菌群的成员，是肠道内的条件致病菌，正常情况下不致病。

肉毒梭状芽孢杆菌（Clostridium botulinum），是革兰氏阳性厌氧芽孢杆菌，鞭毛无荚膜， 广泛分布于自然界、土壤、海洋、湖泊沉积物以及人畜粪便中。该菌在自然界中生命力顽强，在干燥环境中可存活数十年之久，在有氧状态下，一般没有致病性。

艰难梭状芽孢杆菌(Clostridium difficile)又称艰难梭菌，为严格的专性厌氧型细菌，无荚膜，革兰染色阳性粗长杆菌，培养2天后有转为革兰阴性的趋向。主要分布于土壤、水、干草、沙、动物和人的粪便中，此外还大量存在婴儿的肠道中，是新生儿肠道中正常菌群。该菌可引起肾盂肾炎、脑膜炎、腹腔及阴道感染、菌血症和气性坏等，目前是医院内感染的病原菌之一。

牙龈卟啉单胞菌（Porphyromonas gingivalis）是一种与成人牙周炎关系密切的专性厌氧革兰氏阴性球杆菌，也是导致慢性牙周炎最为典型的一种革兰氏阴性厌氧菌，无糖分解特性但具有蛋白分解特性。牙龈卟啉单胞菌存在于健康人群中，并且被认为是宿主适应性病原体，只有当宿主和细菌之间的生态平衡遭到破坏后，才能引起致病。

志贺氏菌（Shigella）通称痢疾杆菌，是一类兼性厌氧型革兰氏阴性短小杆菌，耐寒，能分解葡萄糖，产酸但不产气。根据其抗原构造的不同，可分为痢疾、福氏、鲍氏和宋内志贺氏菌四群，共48个血清型。志贺氏菌是人类细菌性痢疾最为常见的病原菌，主要流行于发展中国家，全世界年病例数超过2亿。

乳酸杆菌(Lactobacillus)是一群杆状或球状的革兰氏阳性菌，因大量乳酸而发酵糖产生命名。其存在广泛，嗜酸性，在pH为3~6的环境中均能生存，是无芽胞杆菌中是耐酸力最强的，一般在厌氧条件下繁殖。该类群细菌分布广泛，动物和人类从口腔到直肠始终都有该菌存在，且绝大多数对动物和人无毒、无害，负担着动物体内重要的生理功能。

双歧杆菌（Bifidobacterium）是一个细菌属名，是一类革兰氏阳性、不运动、细胞呈杆状、一端有时呈分叉状、严格厌氧的细菌。广泛存在于人和动物的消化道、阴道和口腔等生境中，是人和动物肠道菌群的重要组成成员之一，也是一类重要的肠道有益微生物。

幽门螺旋杆菌（Helicobacter pylori）是一种革兰氏阴性杆菌，螺旋形、微需氧、对生长条件要求十分苛刻。目前，该菌是消化系统最常见的感染病菌，全球平均感染率约50%，在一些发展中国家感染率甚至可达到70%左右，被认为是世界上最广泛的感染之一。

弯曲杆菌（Campylobacter），呈逗点状或S形，微需氧，革兰氏阴性细菌。弯曲菌属中有10余种可导致人类疾病，其中最常见的是空肠弯曲菌和结肠弯曲菌，占人弯曲菌感染的90%。弯曲菌在禽类、畜类等动物中广泛分布，该菌主要定居于禽类、畜类等动物的肠道内，也是人畜共患病的病原菌之一。